Структура органов местного самоуправления закреплена статьей 21 Устава муниципального образования Иштанское сельское поселение
1. Структуру органов местного самоуправления Иштанского сельского поселения составляют:
1) Представительный орган муниципального образования – Совет Иштанского сельского поселения Кривошеинского района Томской области(далее – Совет). Сокращенное наименование – Совет Иштанского сельского поселения;
2) Глава муниципального образования – Глава Иштанского сельского поселения Кривошеинского района Томской области (далее – Глава муниципального образования). Сокращенное наименование – Глава Иштанского сельского поселения;
3) Исполнительно-распорядительный орган муниципального образования – Администрация Иштанского сельского поселения;
4) Контрольно — счетный орган.